Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkciQ62074 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkciQ62074 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkciQ62074 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkciQ62074 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkciQ62074 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms