Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itga6Q61739 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itga6Q61739 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itga6Q61739 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itga6Q61739 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itga6Q61739 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itga6Q61739 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.1 ms