Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim25Q61510 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim25Q61510 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim25Q61510 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim25Q61510 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim25Q61510 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms