Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcd1Q61466 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd1Q61466 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarcd1Q61466 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smarcd1Q61466 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms