Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hif1aQ61221 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hif1aQ61221 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hif1aQ61221 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hif1aQ61221 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms