Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mre11Q61216 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mre11Q61216 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mre11Q61216 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mre11Q61216 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mre11Q61216 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms