Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpf4bQ61136 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Prpf4bQ61136 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prpf4bQ61136 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf4bQ61136 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4bQ61136 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms