Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Grik1Q60934 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik1Q60934 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik1Q60934 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik1Q60934 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik1Q60934 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms