Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vdac3Q60931 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vdac3Q60931 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms