Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppp1r1bQ60829 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppp1r1bQ60829 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ppp1r1bQ60829 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppp1r1bQ60829 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppp1r1bQ60829 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp1r1bQ60829 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp1r1bQ60829 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms