Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk2a1Q60737 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a1Q60737 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a1Q60737 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a1Q60737 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms