Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyb561Q60720 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyb561Q60720 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cyb561Q60720 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cyb561Q60720 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms