Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SkiQ60698 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SkiQ60698 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SkiQ60698 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SkiQ60698 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SkiQ60698 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SkiQ60698 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SkiQ60698 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SkiQ60698 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SkiQ60698 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SkiQ60698 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SkiQ60698 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SkiQ60698 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SkiQ60698 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkiQ60698 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SkiQ60698 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms