Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD4Q5VWC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD4Q5VWC8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD4Q5VWC8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD4Q5VWC8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms