Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRCH2Q5VUJ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRCH2Q5VUJ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRCH2Q5VUJ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRCH2Q5VUJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms