Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR78Q5VTH9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
WDR78Q5VTH9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
WDR78Q5VTH9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDR78Q5VTH9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
WDR78Q5VTH9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms