Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
RPRD2Q5VT52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RPRD2Q5VT52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RPRD2Q5VT52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RPRD2Q5VT52 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
RPRD2Q5VT52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RPRD2Q5VT52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms