Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NotoQ5TIS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NotoQ5TIS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NotoQ5TIS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NotoQ5TIS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms