Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO4Q5TGY1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO4Q5TGY1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO4Q5TGY1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO4Q5TGY1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms