Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CFAP70Q5T0N1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CFAP70Q5T0N1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFAP70Q5T0N1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFAP70Q5T0N1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CFAP70Q5T0N1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms