Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL5A1-AS1Q5SY13 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL5A1-AS1Q5SY13 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms