Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmo1Q5SXG7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmo1Q5SXG7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmo1Q5SXG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmo1Q5SXG7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmo1Q5SXG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmo1Q5SXG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmo1Q5SXG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmo1Q5SXG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms