Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myh1Q5SX40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Myh1Q5SX40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myh1Q5SX40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Myh1Q5SX40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myh1Q5SX40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Myh1Q5SX40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms