Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.9 ms