Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap44Q5SSM3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap44Q5SSM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap44Q5SSM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap44Q5SSM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.6 ms