Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAT1Q5SQI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAT1Q5SQI0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAT1Q5SQI0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATAT1Q5SQI0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATAT1Q5SQI0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATAT1Q5SQI0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms