Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc85aQ5SP85 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc85aQ5SP85 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc85aQ5SP85 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc85aQ5SP85 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85aQ5SP85 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms