Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
5730522E02RikQ5SP45 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
5730522E02RikQ5SP45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
5730522E02RikQ5SP45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
5730522E02RikQ5SP45 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms