Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rapgef6Q5NCJ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rapgef6Q5NCJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rapgef6Q5NCJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rapgef6Q5NCJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Rapgef6Q5NCJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rapgef6Q5NCJ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rapgef6Q5NCJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rapgef6Q5NCJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rapgef6Q5NCJ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms