Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CoblQ5NBX1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CoblQ5NBX1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CoblQ5NBX1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CoblQ5NBX1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CoblQ5NBX1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CoblQ5NBX1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CoblQ5NBX1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CoblQ5NBX1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CoblQ5NBX1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms