Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPANXN3Q5MJ09 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPANXN3Q5MJ09 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPANXN3Q5MJ09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms