Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB41Q5JT25 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB41Q5JT25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB41Q5JT25 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB41Q5JT25 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB41Q5JT25 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB41Q5JT25 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB41Q5JT25 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms