Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERC4Q5GLZ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERC4Q5GLZ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERC4Q5GLZ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERC4Q5GLZ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HERC4Q5GLZ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms