Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZC3H12AQ5D1E8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZC3H12AQ5D1E8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZC3H12AQ5D1E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZC3H12AQ5D1E8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms