Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN45

UPF0691 protein C9orf116 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5BN45 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5BN45 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5BN45 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5BN45 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q5BN45 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5BN45 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5BN45 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5BN45 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5BN45 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q5BN45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5BN45 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5BN45 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5BN45 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5BN45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5BN45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q5BN45 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5BN45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5BN45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5BN45 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5BN45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5BN45 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q5BN45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5BN45 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5BN45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5BN45 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5BN45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q5BN45 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q5BN45 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q5BN45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q5BN45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5BN45 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5BN45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5BN45 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5BN45 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q5BN45 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q5BN45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5BN45 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5BN45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5BN45 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5BN45 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q5BN45 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5BN45 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5BN45 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5BN45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q5BN45 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q5BN45 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5BN45 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5BN45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5BN45 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q5BN45 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q5BN45 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q5BN45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q5BN45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q5BN45 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q5BN45 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q5BN45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5BN45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5BN45 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5BN45 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5BN45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5BN45 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5BN45 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5BN45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5BN45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5BN45 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5BN45 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5BN45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5BN45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms