Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ODF2Q5BJF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ODF2Q5BJF6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ODF2Q5BJF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ODF2Q5BJF6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ODF2Q5BJF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms