Protein–RNA interactions for Protein: Q5BIV9

SPRN, Shadow of prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRNQ5BIV9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SPRNQ5BIV9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRNQ5BIV9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRNQ5BIV9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPRNQ5BIV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms