Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC92Q53HC0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC92Q53HC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC92Q53HC0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC92Q53HC0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms