Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FNDC3BQ53EP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC3BQ53EP0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC3BQ53EP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FNDC3BQ53EP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FNDC3BQ53EP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms