Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIN52Q52LA3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIN52Q52LA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIN52Q52LA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms