Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ankrd28Q505D1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd28Q505D1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd28Q505D1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ankrd28Q505D1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms