Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KHDC1Q4VXA5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KHDC1Q4VXA5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KHDC1Q4VXA5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KHDC1Q4VXA5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms