Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Srek1ip1Q4V9W2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srek1ip1Q4V9W2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srek1ip1Q4V9W2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srek1ip1Q4V9W2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms