Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB8Q3ZCM7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB8Q3ZCM7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB8Q3ZCM7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB8Q3ZCM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB8Q3ZCM7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB8Q3ZCM7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB8Q3ZCM7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms