Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Afg1lQ3V384 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Afg1lQ3V384 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Afg1lQ3V384 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Afg1lQ3V384 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Afg1lQ3V384 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms