Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrc43Q3V0L5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lrrc43Q3V0L5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc43Q3V0L5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
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Lrrc43Q3V0L5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc43Q3V0L5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc43Q3V0L5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc43Q3V0L5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
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