Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prdm6Q3UZD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm6Q3UZD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prdm6Q3UZD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm6Q3UZD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prdm6Q3UZD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms