Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Thsd4Q3UTY6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thsd4Q3UTY6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Thsd4Q3UTY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms