Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smim15Q3UTD9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim15Q3UTD9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smim15Q3UTD9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim15Q3UTD9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms