Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubtfl1Q3USZ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubtfl1Q3USZ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubtfl1Q3USZ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubtfl1Q3USZ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubtfl1Q3USZ2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms